La versione Day One contiene
- Il gioco base
- Skin "Retro Prisoner"
- Pacchetto "Contraband"
Ambientato nel 2320 su Callisto, la luna morta di Giove, The Callisto Protocol è la storia di Jacob Lee, un detenuto della prigione Black Iron che dovrà lottare per la sua vita quando una misteriosa minaccia biologica getterà il satellite nel caos. Le guardie della prigione e gli altri detenuti stanno mutando in orribili mostri chiamati Biofagi: Jacob dovrà annientarli per sopravvivere e scoprire gli oscuri segreti della United Jupiter Company.