In Yu-Gi-Oh! GX, due giocatori si affrontano in una battaglia coinvolgente, sfidandosi in un Match composto da tre Duelli. Serviranno abilit , pratica, strategia e fortuna per vincere il Match, perch(c) molte sono le strategie che i giocatori possono utilizzare per sconfiggere il proprio avversario Le battaglie principali sono condotte tra mostri incredibili di oltre 20 tipi, ciascuno con le proprie abilit peculiari ed il proprio stile di combattimento. In più, i giocatori possono usare la magia, piazzare trappole, modificare lo stesso terreno di battaglia, ed addirittura fondere insieme due mostri per crearne uno di immenso potere!